DNK barkoding

Na BioSens Institutu DNK barkoding se primenuje za potrebe proučavanja skrivenog diverziteta osolikih muva. Ovaj pristup nam omogućava da procenimo raznovrsnost kriptičnih vrsta osolikih muva, ali je važan i za identifikaciju juvenilnih stadiuma jedinki do nivoa vrsta. Tokom poslednjih nekoliko godina radili smo na razvoju DNK barkod biblioteke osolikih muva. Poredeći DNK barkod sekvencu novog uzorka sa sekvencama u DNK barkod biblioteci u mogućnosti smo da utvrdimo da li uzorak pripada poznatoj vrsti ili predstavlja nov nalaz. Osim sekvence 5’COI gena koja je prihvaćena kao zvanični DNK barkod, u našim istraživanjima koristimo i sekvence 3’COI gena kao i dodatne nuklearne molekularne markere kao što su unutrašnji transkribujući spejser 2 (ITS2) i deo sekvence 28S rRNK gena. Pored toga, u toku je i nov projekat posvećen razvoju pristupa višestrukih amplikona za DNA barkoding osolikih muva primenom tehnologije sekvenciranja nove generacije (NGS).